ε- polilizīns ir gaiši dzeltens pulveris ar spēcīgu higroskopiskumu un nedaudz rūgtu garšu. Tas ir taisnas ķēdes lizīna polimērs. To neietekmē pH vērtība, tas ir termiski stabils (120 grādi, 20 minūtes) un var kavēt karstumizturīgas baktērijas, tāpēc pēc pievienošanas to var termiski apstrādāt. Taču, saskaroties ar skābiem polisaharīdiem, hidrohlorīda sāļiem, fosfātiem, vara joniem utt., to aktivitāte saistīšanās dēļ var samazināties. Kombinācijā ar sālsskābi, citronskābi, ābolskābi, glicīnu un augstākiem tauku glicerīdiem tam ir sinerģiska iedarbība. Molekulmasa starp 3600-4300 ε- Polilizīnam ir vislabākā antibakteriālā aktivitāte, un, ja tā molekulmasa ir mazāka par 1300, ε-polilizīns zaudē savu antibakteriālo aktivitāti. Sakarā ar to, ka polilizīns ir maisījums, tam nav noteikta kušanas temperatūra, un tas sāk mīkstināt un sadalīties virs 250 grādiem. ε Polilizīns šķīst ūdenī un nedaudz šķīst etanolā. Tā raksturojuma infrasarkanā spektra analīze liecina, ka ir spēcīgas absorbcijas maksimumi pie 1680-1640cm-1 un 1580-1520cm-1.